Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms