Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms