Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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