Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3543D3Z235 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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