Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Samd1D3YXK1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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