Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmf1B9EKI3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms