Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syce3B5KM66 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms