Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usf3B2RUQ2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms