Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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