Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brpf1B2RRD7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Brpf1B2RRD7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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