Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Gm6880A3KG45 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6880A3KG45 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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