Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtf1A2AQ19 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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