Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17087V9GXQ2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms