Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Robo3Q9Z2I4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Robo3Q9Z2I4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Robo3Q9Z2I4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Robo3Q9Z2I4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Robo3Q9Z2I4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Robo3Q9Z2I4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms