Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms