Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cib1Q9Z0F4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms