Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TapbpQ9R233 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms