Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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