Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rad18Q9QXK2 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms