Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms