Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mid2Q9QUS6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms