Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PolkQ9QUG2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PolkQ9QUG2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms