Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod4Q9JLH8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms