Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rnft1Q9DCN7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms