Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PmpcaQ9DC61 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PmpcaQ9DC61 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms