Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rnf6Q9DBU5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rnf6Q9DBU5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rnf6Q9DBU5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rnf6Q9DBU5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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