Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd9Q9D9M4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms