Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gtf3c6Q9D8P7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gtf3c6Q9D8P7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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