Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp5Q9D7S9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp5Q9D7S9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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