Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cldn23Q9D7D7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms