Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lonrf3Q9D4H7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lonrf3Q9D4H7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lonrf3Q9D4H7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lonrf3Q9D4H7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lonrf3Q9D4H7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lonrf3Q9D4H7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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