Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms