Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt20Q9D312 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Krt20Q9D312 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Krt20Q9D312 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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