Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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