Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Syf2Q9D198 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms