Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms