Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9CWU4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms