Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atxn3Q9CVD2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atxn3Q9CVD2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms