Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ifitm3Q9CQW9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms