Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp3Q9CQ10 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Chmp3Q9CQ10 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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