Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
GpnmbQ99P91 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms