Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms