Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gdpd3Q99LY2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gdpd3Q99LY2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gdpd3Q99LY2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gdpd3Q99LY2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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