Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rcbtb2Q99LJ7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms