Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp16Q99LG0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms