Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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