Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Def8Q99J78 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Def8Q99J78 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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