Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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