Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CsprsQ99388 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms