Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Smg8Q8VE18 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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